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Activación conformacional inducida por DNA de la proteína RepA: estudios mediante espectroscopía de fluorescencia

Dávila Fajardo, Cristina Lucía (2010) Activación conformacional inducida por DNA de la proteína RepA: estudios mediante espectroscopía de fluorescencia. Tesis PhD.

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Abstract

La unión de la proteína iniciadora de la replicación del plásmido pPS10 (RepA) a las secuencias específicas del operador (IR) y de un iterón (1DR) había sido ya estudiadas en nuestro grupo por técnicas EMSA (Giraldo y
cols., 1998). Uno de los primeros objetivos en este trabajo radicaba en la caracterización espectroscópica del único residuo de triptófano (Trp94) de RepA para
explorar su potencialidad como sonda: i) en el estudio de la interacción de la
proteína con las secuencias del operador y de un iterón en disolución y ii)
donador en estudios de transferencia de energía en RepA. El estudio de estas interacciones tanto en soluciones ideales como en condiciones de aglomeración macromolecular mediante técnicas de espectroscopia de fluorescencia en estado estacionario y en resolución
temporal empleando una sonda fluorescente extrínseca. La estructura del dímero de RepA comparada con la del monómero del iniciador homólogo RepE muestra que la disociación de los dímeros en monómeros lleva consigo un cambio estructural, que se materializa en un
incremento en la estructura β-laminar a costa del componente α-helicoidal, compatible con los resultados espectroscópicos obtenidos previamente en nuestro laboratorio (Díaz-López, 2003; Giraldo y cols., 2003). Asimismo dicho cambio conformacional resulta en una alteración de la compacidad entre los dos dominios de RepA (Giraldo 98; 2004). Por lo tanto, nos propusimos estudiar estos cambios estructurales mediante técnicas FRET que
nos permitieran estimar distancias entre el Trp94 intrínseco de la proteína RepA (donador) y otros residuos de la misma marcados covalentemente con una sonda fluorescente (aceptor), tanto en el estado dimérico como en el monomérico.

Item Type:Thesis (PhD)
Additional Information:Tesis de la Universidad Complutense de Madrid, Facultad de Farmacia, Departamento de Microbiología II, leída el 09-02-2006
Directors:
DirectorsDirector email
Giraldo Suárez, RafaelUNSPECIFIED
Lillo Villalobos, PilarUNSPECIFIED
Uncontrolled Keywords:Espectroscopía, ADN
Subjects:Medical sciences > Pharmacy > Microbiology
ID Code:10491
Deposited On:23 Apr 2010 07:45
Last Modified:18 May 2010 11:13

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