Universidad Complutense de Madrid
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Epidemiological and molecular analysis of virulence and antibiotic resistance in Acinetobacter baumannii
Análisis epidemiológico y molecular de la virulencia y la antibiorresistencia en Acinetobacter baumannii

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Dahdouh, Elias (2017) Epidemiological and molecular analysis of virulence and antibiotic resistance in Acinetobacter baumannii. [Thesis]

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Abstract

Acinetobacter baumannii is a highly versatile nosocomial pathogen that is implicated in several nosocomial infections among critically ill patients and results in high mortality rates. These infections include ventilator associated pneumonia, bloodstream infections, urinary tract infections, and burn wound infections. Multi-Drug Resistant (MDR), and especially Carbapenem Resistant Acinetobacter baumannii (CRAB) isolates are also sharply increasing in frequency, forcing clinicians to revert to the use of colistin. This organism has numerous intrinsic resistance mechanisms, virulence determinants, and an elastic genome that allows it to acquire resistance to almost all antimicrobial agents rather easily. The acquisition of oxacillinases (OXAs) is one of the most common mechanisms of acquiring carbapenem resistance. Moreover, some clinically important International Clones (ICs) with MDR profiles are disseminated all over the world. A. baumannii is known to differentially express virulence determinants and few studies hint at their relationship with antimicrobial resistance. However, this relationship is not extensively investigated. In this Doctoral Thesis, the relationship between clonality, virulence, and antimicrobial resistance is investigated in two sets of clinical isolates obtained from Spain and Lebanon, two countries in which the rate of CRAB isolates is notoriously high. Our aim is providing clinicians and infection control specialists with tools that could be used to assess the infecting strain based on initial clinical data that could improve the chances of successful therapy and limit the spread of MDR and CRAB isolates. Additionally, it is our aim to better understand the interaction between virulence and antibiotic resistance...

Resumen (otros idiomas)

Acinetobacter baumannii es un patógeno nosocomial versátil implicado en importantes infecciones como la neumonía asociada a ventilación mecánica, infecciones del torrente sanguíneo, del tracto urinario, de heridas y de quemaduras en pacientes críticamente enfermos. Se han encontrado elevadas tasas de resistencia a muchos grupos de antibióticos en esta especie, incluyendo carbapenemas. La adquisición de resistencias se debe a su genoma elástico. Por ejemplo, la adquisición de OXAs es uno de los mecanismos más comunes en A. baumannii en su resistencia a carbapenemas, y las cepas resistentes a este antibiótico están asociadas con algunos clones internacionales. A. baumannii expresa factores de virulencia de una manera diferente en las diferentes cepas y algunos estudios muestran una relación entre virulencia y antibiorresistencia, que aún no está muy desarrollada. En esta Tesis Doctoral, se investiga la relación entre clonalidad, virulencia, y antibiorresistencia en cepas aisladas en España y el Líbano, dos países de la cuenca Mediterránea. Nuestro objetivo con este estudio es apoyar a los expertos en el control de infecciones, y proporcionar las herramientas necesarias para combatir la propagación de cepas resistentes a diferentes antibióticos. Además, con todo ello intentamos comprender mejor la compleja relación entre virulencia y resistencia antibiótica. Cincuenta y nueve cepas de A. baumannii fueron aisladas del HU-LP (España) y 90 del SGH-UMC (Líbano). Se identificaron las cepas utilizando tiras API, amplificando por PCR genes de OXA-51, y mediante análisis por MALDI-TOF MS. Se analizó la resistencia antibiótica de las cepas según la guía de CLSI, se determinó la clonalidad por PFGE y se realizó la amplificación diferencial de genes “housekeeping”. Los genes de carbapenemasas se detectaron por PCR y la formación de biofilms, hemólisis, movilidad, actividad proteolítica, y tiempos de generación se detectaron fenotípicamente. A continuación, se llevó a cabo la secuenciación del operón pmrCAB y el genoma de cepas resistentes a colistina. Además, se investigaron los patrones de formación de biofilms, después de cultivar las cepas en soportes de acero inoxidables, mediante recuento de las células adheridas y microscopía confocal...

Item Type:Thesis
Additional Information:

Tesis inédita de la Universidad Complutense de Madrid, Facultad de Veterinaria, Departamento de Bioquímica y Biología Molecular IV, leída el 21/12/2016

Directors:
DirectorsDirector email
Suárez Rodríguez, Mónica
Uncontrolled Keywords:Veterinary bacteriology
Palabras clave (otros idiomas):Bacteriología veterinaria
Subjects:Medical sciences > Veterinary > Microbiology
ID Code:44189
Deposited On:02 Aug 2017 10:00
Last Modified:02 Aug 2017 10:00

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