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Martínez Ladrón de Guevara, Jorge (2013) BIOSEQ: una librería para bioinformática en R. [Trabajo Fin de Máster]
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Abstract
Este trabajo desarrolla temas de programación avanzada en R, como la programación orientada a objetos o el desarrollo de librerías externas C para el diseño y desarrollo de
paquetes R. Además, describe la estructura de carpetas y archivos de un paquete R y el proceso de verificación y compilación necesario para su distribución. Por último,
describe las funciones Smith-Waterman y Needleman-Wunsch para alineamiento de secuencias, incluidas en la librería BioSeq.
[ABSTRACT]
This document focuses on advanced topics in R programming useful for package development, covering Object Oriented Programming and the interface with C libraries.
This work also describes the structure of an R packages and its contents, and the compilation process necessary for distribution. Finally, it describes Smith-Waterman and Needleman-Wunsch functions for sequence alignment which are included in BioSeq package
| Item Type: | Trabajo Fin de Máster |
|---|---|
| Additional Information: | Trabajo de Fin de Máster en Ingeniería de Computadores |
| Directors: | Directors López López, María Victoria González Pérez, Beatriz |
| Uncontrolled Keywords: | Programación en R, Clases S3, Clases S4, Librerías externas C para R, Desarrollo de paquetes en R, Análisis de secuencias, Smith-Waterman, Needleman-Wunsch, Bioinformática, R programming language, S3 classes, S4 classes, C external libraries for R, Package development in R, Sequence analysis, Smith-Waterman, Needleman-Wunsch, Bioinformatics |
| Subjects: | Sciences > Computer science > Programming languages (Electronic computers) |
| ID Code: | 22633 |
| Deposited On: | 31 Jul 2013 12:02 |
| Last Modified: | 23 Mar 2020 13:33 |
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